Hi!

My name is Serhii Hamotskyi, welcome to my personal website!

It was created as a way to organize information about all the things I'm interested in. The main parts are listed on the right.

Things that live here:

  1. Work log, where I note things I feel I'll have to Google later.
  2. Journal, very similar but about non-IT topics.
  3. Blog for rare longer-form posts (last one below).

Feel free to look at what you can find here and enjoy yourself.

~17% of my country is occupied by Russia, and horrible things are happening there. You can help stop this! If you can donate - I contribute to (and fully trust) Come Back Alive and Hospitallers, but there are also other ways to help.

Work log Journal Blog
About me Projects

Latest posts from the Work log

Day 2074 / Developing a 3D Slicer extension

Debugging

Basics

Starting Slicer

Loads the module automatically (for some reason doing it manually doesn’t preserve it across restarts?..)

Slicer  --additional-module-path /path/to/my/extension/one/lower/than/what/i/would/pick/in/Slicer/GUI

Logging

CLI modules

Latency etc.

Solution: CLI module (not extension), which can be added to new extension from extension editor.

Now I understad this better: Module Overview — 3D Slicer documentation

  • CLI modules are simple I/O, non-blocking, that’s where the networkig logic should go to
  • scripted are python scripts with GUIs

  1. linked by the less useful Python debugging — 3D Slicer documentation ↩︎

  2. How to use logging in an extension? - #2 by lassoan - Development - 3D Slicer Community ↩︎

Day 2066 / 3dslicer extension deployment options

Slicer --help:

  --testing                                     Activate testing mode. It implies --disable-settings and --ignore-slicerrc. (default: false)
  --disable-python                              Disable python support. This is equivalent to build the application with Slicer_USE_PYTHONQT=OFF.
  --python-script                               Python script to execute after slicer loads.
  --python-code                                 Python code to execute after slicer loads.
  -c                                            Python code to execute after slicer loads. By default, no modules are loaded and Slicer exits afterward.
  --ignore-slicerrc                             Do not load the Slicer resource file (~/.slicerrc.py).
  --additional-module-path                      Additional module path to consider when searching for modules to load.
  --additional-module-paths                     List of additional module path to consider when searching for modules to load.

  1. Extensions — 3D Slicer documentation ↩︎

  2. Extensions Manager — 3D Slicer documentation ↩︎ ↩︎

  3. Run Slicer in your web browser - as a Jupyter notebook or as a full application - Announcements - 3D Slicer Community ↩︎

  4. GitHub - Slicer/SlicerDocker: Build, package, test, and run 3D Slicer and Slicer Extensions in Docker. ↩︎

  5. Run Slicer in your web browser - as a Jupyter notebook or as a full application - Announcements - 3D Slicer Community ↩︎ ↩︎

Day 2044 / rsync on file changes with inotifywatch

inotifywait(1) - Linux man page

#!/bin/sh
while inotifywait --format '%:e %f' p.* *.bib; do
  sleep 1  # files get moved often
  echo "rsync!"
  rsync -avzirh --progress  p.* *.bib me@server.net:dir
done

Day 2043 / Boltctl monitor exists

boltctl monitor shows changes as they happens — nice when something breaks. I used to do a lot of watch boltctl list before in this exact scenario

(having a monitor subcommand in your thing says a lot about stuff, actually, — the best interpretation is that it’s written with developers in mind)

Day 2041 / Quarto CSS grid to better position absolute elements

Very proud of this idea, haha :)

For absolute positioned elements one needs to “guess” the correct sizes etc., may not be trivial. Using a pixel ruler won’t help because the .absolute coords don’t map to the screen ones.

Solution:

.grid {
  // https://stackoverflow.com/questions/4191260/drawing-a-grid-using-css
  background-image:
    repeating-linear-gradient(lightblue 0 2px, transparent 2px 100%),
    repeating-linear-gradient(90deg, lightblue 0 2px, transparent 2px 100%);
  background-size: 50px 50px;
  //border: 2px solid red;
}

.smallgrid {
  background-image:
    repeating-linear-gradient(#ccc 0 1px, transparent 1px 100%),
    repeating-linear-gradient(90deg, #ccc 0 1px, transparent 1px 100%);
  background-size: 10px 10px;
  width: 100%;
  height: 100%;
}

::::: {.absolute left=0 right=0 top=0 bottom=0 .grid}
::: {.smallgrid}
:::
:::::

Pasted image 20240803004440.png

It’s not exactly aligned but close enough to judge the widths and heights involved!

Rectangle in the pic is:

:::: {.redrect .absolute right=200 top=130 width=200 height=100}
::::

(And the small grid can be omitted if not needed by removing the div in the middle. )

For bonus points, can be saved as a file and included if needed:

{\{< include ../_shared/smallgrid.qmd >}\}

ALSO:

// show the border of the slide
.reveal .slides {
  border: 1px dashed red;
}

Day 2040 / Quarto vertical align one last time

DAMN.

Figures – Quarto:

:::: {layout="1,1,1],[1],[1,1,1" layout-valign="center"}

if it’s a layout I do get a valign thing. I just have to use layouts, not columns. Damn.

Day 2039 / quarto positioning SVG absolute

This doesn’t work on SVGs for me:

![](images/02/svgs/02_seqsiii.svg){.absolute top=0 left=0}

This does:

::: {.absolute top=0 left=0}
![](images/02/svgs/02_seqsiii.svg)
:::

Day 2038 / You can enter svg code as html and animate graphviz like this

SO.

One can literally generate a plot w/ graphviz, export as svg, open and edit in inkscape, save as optimized svg, paste into quarto, and manually add the correct class="fragment" data-fragment-index=4 bits to the relevant groups.

Insert with the usual {=html} thing.

Damn.

Day 2037 / leaderline.js in a neat library to draw arrows between HTML elements

LeaderLine

almost works with quarto, except that line.position needs to be called on slide change — ergo likely won’t work in pdf export mode.

Day 2033 / Animating plots in quarto

maurosilber/pyfragments: Animated figures for Quarto installs as-is

IT WORKS FOR PDF MODE TOO! And uses fragments

# | fig-width: 15
# | fig-height: 10
# | output: asis
import matplotlib.pyplot as plt
from pyfragments import AnimatedFigure

with AnimatedFigure() as ani:
# Data for plotting
  train_loss = [1.0, 0.6, 0.3, 0.2, 0.1]
  val_loss = [1.2, 0.8, 0.5, 0.4, 0.6]
  iterations = [1, 2, 3, 4, 5]

  plt.xlim(0, 6)
  plt.ylim(0, 1.5)

# Labels and legend
  plt.xlabel('Trainingsiterationen', fontsize=14)
  plt.ylabel('Loss', fontsize=14)
  plt.legend(loc='upper right', fontsize=12)

# Plot
  for x in range(len(train_loss)+1):
    with ani.fragment():
      plt.plot(iterations[:x], train_loss[:x], 'bo-', label='Training', linewidth=2)
      plt.plot(iterations[:x], val_loss[:x], 'go-', label='Validation', linewidth=2)

# Add a dashed vertical line in the middle
  mid_iteration = (iterations[0] + iterations[-1]) / 2

  with ani.fragment():
    plt.axvline(x=mid_iteration, color='r', linestyle='--', linewidth=1.5)

Latest post from Blog

'The Hacker Manifesto', переклад українською

Оригінал: .:: Phrack Magazine ::.
Контекст: Маніфест хакера — Вікіпедія / Hacker Manifesto - Wikipedia
Існуючий дуже класний переклад, не відкривав, поки не закінчив свій: Маніфест хакера | Hacker’s Manifesto | webKnjaZ: be a LifeHacker

                               ==Phrack Inc.==

                    Том I, випуск 7, Ph-айл[0] 3 з 10

=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
Наступне було написано невдовзі після мого арешту...

	                        \/\Совість хакера/\/

	                               автор:

	                          +++The Mentor+++

	                           8 січня 1986р.
=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

	Сьогодні ще одного спіймали, пишуть у всіх газетах. "Кібер-скандал:
підлітку повідомили про підозру", "Кіберзлочинця затримали після
проникнення в систему банку".
	Тупа школота[1], вони всі однакові.

	Та чи ви, з вашою трафаретною ментальністю[2] та знаннями 
інформатики зразка першої половини пʼятидесятих[3], коли-небудь дивилися 
в душу хакера?[4] Чи вас колись цікавило, що є причиною його поведінки[5], 
які сили на нього впливали, що його сформувало?
	Я хакер, ласкаво прошу у мій світ...
	Мій світ почався ще зі школи... Я розумніший за більшість інших
дітей, і дурниці, які нам викладають, мені набридають.
	Тупий відстаючий[6], вони всі однакові.

	Восьмий, девʼятий, десятий, одинадцятий клас[7]. В пʼятнадцятий
раз слухаю, як вчителька пояснює, як скорочувати дроби. Мені все ясно. "Ні, 
Вікторія Миколаївна[8], я не написав проміжні кроки, я розвʼязав все усно..."
	Тупий підліток. Мабуть списав. Всі вони такі.

	Сьогодні я зробив відкриття. Я знайшов компʼютер. Ха, почекай-но,
це круто. Він робить те, що я від нього хочу. І якщо він помиляється,
це тому, що помилився я. А не тому що він мене не любить...
                         Або відчуває від мене загрозу...
                         Або думає що я тіпа самий умний[9]...
                         Або не любить викладати[10] і йому тут не місце...
	Тупий підліток. Він постійно тільки грає в свої ігри. Всі вони такі...

	Потім це відбулось... відчинились двері в світ... несучись телефонною 
лінією як героїн венами наркомана, надсилається електронний пульс,
шукається спасіння від невігластва навколо...[11] Знаходиться борд.[12]
	"Це воно... це те, до чого я належу..."
	Я з усіма тут знайомий... попри те, що я з ними ніколи не 
зустрічався, не розмовляв, і колись можливо більше нічого не чутиму про 
них... Я їх всіх знаю...
	Тупий підліток. Знову займає телефонну лінію... Вони всі однакові.

	Та можете не сумніватись,[13] що ми всі однакові... Нас годували
дитячими сумішами з ложки, коли ми хотіли стейк... а ті куски мʼяса, які 
до нас все ж потрапляли, були вже пережовані і без смаку. Над нами
панували садисти, або нас ігнорували байдужі. Для тих, хто хотіли чомусь 
нас навчити, ми були вдячними учнями, але їх було як краплин дощу в
пустелі.

	Цей світ зараз наш... світ електрона і комутатора, світ краси
бода[14]. Ми користуємося існуючою послугою не платячи за те, що могло б 
бути дуже дешевим, якби ним не завідували ненажерливі бариги[15], і ви 
називаєте нас злочинцями. Ми досліджуємо... і ви називаєте нас 
злочинцями. Ми шукаємо знання... і ви називаєте нас злочинцями. Ми 
існуємо без кольору шкіри, без національності і без релігійної 
нетерпимості... і ви називаєте нас злочинцями. Ви будуєте атомні бомби, 
ви ведете війни, ви вбиваєте, обманюєте, і брешете нам, намагаючись 
заставити нас повірити, що ви це робите для нашого блага, і попри все - 
це ми тут злочинці.

	Так, я злочинець. Мій злочин - моя допитливість. Мій злочин - 
оцінювати людей по тому, що вони кажуть і думають, а не по тому, як 
вони виглядають. Мій злочин в тому, що я вас перехитрив, і ви мене 
ніколи не пробачите за це.

	Я хакер, і це мій маніфест. Можливо ви зупините мене як особу, але ви 
ніколи не зупините нас всіх... зрештою, ми всі однакові.

Замітки:

  1. Ph-айл: worst of both worlds between phile and файл
  2. Damn kids: тупі/кляті/грьобані діти/школота1/малолітки2? Дякую цьому твіту Букви, який дає мені моральне право використовувати слово “школота”, бо нічого інше не клеїлося (“Окаяні дітлахи!")
  3. three-piece-psychology: інтерпретую як невисоку оцінку розвитку внутрішнього світу. Тому: пересічним/шаблонним/банальним/трафаретним3/примітивним/нехитрим/безхитрим; psychology: ‘інтелект’ але не зовсім, мені подобається ‘ментальність’
  4. and 1950’s technobrain: Німецький переклад, який сподобався англіцизмами та дав ідею перекласти technobrain в значенні “знання про компʼютери”, а не слово в слово: Berühmte Manifeste 2 – openPunk
  5. хакер/гакер: Вікіпедія вважає обидва допустимими; сам Авраменко ссилаючись на ті самі правила українського правопису теж вважає обидва допустимими, але все ж любить “г” більше (Хакер чи гакер - експрес-урок - YouTube). А я не можу і не буду. Хакер. I will die on this hill.
  6. what makes him tick: TODO, нічого не подобається. Що його рухає/надихає, що у нього в середині, …
  7. underachiever: хай буде “відстаючий”. Хоча пригадую з ЗНО, що суфікси уч/юч обмежені у вживанні, правильніше ВІДСТАЛИЙ мені не подобається.
  8. junior high or high school: тут додаю драми замість дослівності, тому що все ближче до оригіналу, що я можу придумати, занадто канцеляристично: “я закінчую базову чи повну загальну середню освіту”..?
  9. Ms. Smith:
  10. I’m a smart ass
  11. doesn’t like teaching: оплакую невикористаний варіант від душі “ненавидить себе, дітей, і педагогіку”. Дуже оплакую.
  12. a refuge from the day-to-day incompetencies is sought
  13. a board is found: мається на увазі електронна дошка оголошень (BBS — Вікіпедія), дід форумів і прадід іміджбордів. Найцікавіше слово для перекладу. Якщо буде “борд” то збережеться драматизм оригіналу, але є шанси, що хтось спутає з іміджбордами. Коли вони були популярні, нормальні люди в Україні їх не називали ніяк, російською були варіанти “доска”, “бибиэска”4. “BBS” був би найпростішим виходом; “електронна дошка оголошень” знову ж таки канцеляризм. По контексту далі очевидно, що мова йде про якесь спілкування, тому хай буде “борд”, принесу в жертву однозначність і зрозумілість милозвучності.
  14. you bet your ass we’re all alike: як же складно підбирати такі речі. Умовні embeddings з ML тут були б в тему. “Дай мені щось на кшталт ‘авжеж’ тільки більш emphatical”. Попередня версія “Авжеж ми всі однакові!”
    1. You bet – phrases: базара нет, по любому, я вас умоляю
    2. Будьте певні5
    3. ЩЕ Б ПАК — СИНОНІМІЯ | Горох — українські словники
      1. Авжеж?6
  15. the beauty of the baud: Бод — Вікіпедія Нехай мій (і єдиний можливий) переклад буде всім настільки ж зрозумілим, наскільки мені був зрозумілий оригінал, коли я його читав вперше.
  16. profitteering gluttons

Hat tip to:

Random:

  1. (1) Букви on X: “@donikroman Пане, Ви знову з матами, як школота ¯_(ツ)_/¯ Зауваження, до слова, правильне, українською мовою, а не “на українській мові”, це калька з російської. Може б варто почати з такого? https://t.co/LEEEIX9Bwd” / X ↩︎

  2. „підліток“ синоніми, антоніми, відмінки та тлумачення слова ↩︎

  3. ПРОЗАЇЧНИЙ — СИНОНІМІЯ | Горох — українські словники ↩︎

  4. BBS | зеркало лурк Lurkmore ↩︎

  5. ВПЕВНЕНИЙ — СЛОВОВЖИВАННЯ | Горох — українські словники ↩︎

  6. ЗВИЧАЙНО — СЛОВОВЖИВАННЯ | Горох — українські словники ↩︎